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Unité Aquaculture

Dirigée par : Dr Maryline HOUSSIN (PhD, HDR) 

Chercheur(e) associé(e) à : équipe RECAP du laboratoire BOREA

Objectifs : diagnostiquer et mieux comprendre le risque infectieux afin d’aider les professionnels à la gestion des cheptels.

 

Depuis plus de 15 ans LABÉO s’est fortement engagé sur la thématique des mortalités ostréicoles(principalement sur le volet des pathogènes) et depuis 10 ans sur celles mytilicoles.

Dès 2008, 3 personnes permanentes ont été dédiées à l’unité Aquaculture. Deux thèses ont été soutenues sur l’infectiosité des variants herpétiques de l’huître Crassostrea (Magallana) gigas tandis que trois autres thèses, dont deux en cours, ont permis d’étudier les pathogènes pouvant être en lien avec les mortalités des moules .

Depuis quelques années nous avons également développé des connaissances en raniculture et pisciculture notamment dans le domaine de l’élevage des truites.

Les thématiques de recherche de cette unité sont (cliquez sur les projets pour les découvrir) :

Thématique pathologie ostréicole :

  • Thèse d’ Erika BURIOLI 2017
    • Etude approfondie de la variabilité génétique et des facteurs de virulence du variant OsHV-1µVar et évaluation des facteurs capables de conditionner le développement de la maladie dans l’huitre
    • Première publication du séquençage complet du virus OsHV-1 µvar responsable des mortalités massives d’huîtres creuse….
  • Projet DYMORPLO 2016
    • Etudier la dynamique et l’ampleur des mortalités chez les huîtres au cours d’un cycle d’élevage selon leur mode de provenance (écloserie et captage naturel)
    • Aide aux professionnels: Développement d’un outil permettant de différencier la provenance du naissain (pleine mer/écloserie) par un test génétique (ajouter lien sur une fiche pour décrire l’analyse filiation si ce n’est pas encore au catalogue) et mise en place d’un outil permettant de différencier les huitres diploïdes des huitres triploïdes par cytométrie .
      • Etude des variants du virus OsHV-1 et étude de l’infectiosité de OsHV-1µVar chez l’huître creuse.
      • Description d’une période réfractaire à l’infection après un épisode de mortalité.
      • Développement d’une méthode de quantification du virus reconnue comme technique officielle par la DGAL
      • Aide aux professionnels: Mise au point d’un protocole de qualification des lots d’huître (ajouter lien au catalogue du labo pour le prix d’une certif) introduits sur les parcs afin de diminuer les pertes ostréicoles
      • Mise en place d’une pièce expérimentale zootechnique

Thématique maladies des moules :

  • Projet FRALIOMY : Caractérisation de Francisella halioticida présente chez Mytilus spp (Thèse de Mathieu CHEVRETTE en cours 2024-2027)
    • Etudier les facteurs influençant l’infectiosité de la bactérie Francisella halioticida: intéractions environnement-hôte-pathogène-microbiote.
  • Projet CARUTAH 2023-2024
    • Caractériser l’état écologique du cheptel mytilicole d’Utah Beach
  • Projet EPC : Emergence des pathogènes chez les bivalves : vers une meilleure compréhension des maladies et vers un développement de méthodes de gestion ( Thèse d’ Hélène BOURAS en cours 2021-2024)
    • Etudier la pathogénicité de Francisella halioticida sur les moules bleues Mytilus edulis.
    • Premier isolement de la souche Francisella halioticida à partir de moule. Plusieurs espèces du genre Francisella sont présentes dans les moules françaises dont certaines sont
    • Etude approfondie de l’expérience « -omiques » qui a permis de mieux comprendre le développement de la maladie (transcriptomique, protéomique, peptidomique, métagénomique)
  • Projet EMINOR: Etude des populations Mytilicoles sauvages et d’élevage en Normandie 2020-2021
    • Apporter des éléments à la compréhension de la dynamique du recrutement sur les gisements subtidaux de moules sauvages
    • Comprendre l’origine des mortalités anormales des moules afin de réduire leur impact sur la production des moules d’élevage
  • Thèse de Maud CHARLES 2020
    • Contribuer à la compréhension du phénomène de mortalité mytilicole
    • Première détection mondiale de l’ADN de Francisella halioticida dans des moules moribondes.
    • Développement d’une méthode de détection de la bactérie par PCR en temps réel Taqman
  • Projet BILIGNCELL: Etude de la néoplasie des moules 2016-2017
    • Mise au point d’un outil d’identification de la néoplasie non invasif

Thématique Raniculture :

  • Pathologies et zoonoses dans des élevages de grenouilles
  • Valorisation des co-produits issus de l’élevage de grenouilles
  • RANNIGED : Optimisation de techniques d’élevage

Thématique Pisciculture :

  • Projet SANSA
    • Déterminer les principales problématiques sanitaires dans les élevages de truites
    • Comprendre et lutter contre l’augmentation des infections liées aux flavobactéries
  • Projet Rhabdoveille
    • Développement d’outil PCR pour la détection des virus à déclaration obligatoire SHV et NHI dans l’environnement naturel
  • Pathologies dans un élevage d’hippocampe