Unité Mécanismes infectieux et Émergences
Dirigée par : Stéphane Pronost
Chercheur : Unité UR7450 BIOTARGEN
Objectifs :
• mieux comprendre les mécanismes cellulaires et moléculaires des infections et surveiller l’émergence de nouveaux pathogènes.
La compréhension des mécanismes cellulaires et moléculaires des infections est un préalable à la découverte de nouveaux moyens de lutte qu’il s’agissent de vaccins ou de traitements antiviraux pour des virus tels que les herpèsvirus équins ou le virus de la grippe équine. L’étude de la survie des virus dans l’environnement est également un élément majeur pour optimiser les mesures de biosécurité. Ces travaux nécessitent le développement de modèles d’études expérimentaux par des techniques de référence classiques (culture cellulaire, qPCR,…), mais également par des méthodes innovantes telles que celles développées sur la plateforme IMPEDANCELL (Real-Time Cell Analysis, Live Cell Imaging Analysis, Well Plate Microfluidic Technology..) ou dans le cadre de partenariats (INRAE pour les organoïdes)
La surveillance de pathogènes émergents est un autre moyen efficace de lutte. Il est en effet nécessaire d’identifier le plus rapidement possible l’émergence de nouveaux pathogènes (Hépacivirus équins, Parvovirus équins, …) ou l’apparition de nouvelles souches pour les pathogènes endémiques
Les thématiques de recherche de cette unité sont (cliquez sur les projets pour les découvrir) :
La Rhinopneumonie équine
Projet HVE4 IRCP – Thèse de Camille Normand
– Recherche de nouveaux composés antiviraux contre la rhinopneumonie équine
– Caractérisation génomique des HVEs
– Etude de la survie du virus HVE-4 dans l’environnement
Projet AVEqACTIVE – Post-doctorat de Gabrielle Sutton
– Etude de l’effet synergique de molécules antivirales contre l’HVE-1
-Analyse transcriptomique de l’infection à l’HVE-1
Projet OVERLORD – Thèse de Gabrielle Sutton
– Etude de l’évolution des variants HVE-1 lors d’épizooties par MLST
– Caractérisation d’un nouveau variant C2254 (ORF30), première mise en évidence.
– Caractérisation d’alpha herpèsvirus des équidés : HVE-8 et HVE-9
– Nouvelle approche de la mesure des anticorps anti-EHV par impédancemétrie
Projet SAVE – Thèse de Côme Thieulent
-Recherche de nouveaux composés antiviraux contre la rhinopneumonie équine : criblage sur la plateforme IMPEDANCELL
– Caractérisation de ces composés par leur action sur un panel de souches HVE-1
-Etude in vivo de l’effet du ganciclovir contre l’HVE-1 (Variant C2254)- Collaboration INRAE-PFIE
La grippe équine
Projet EquInfluenza (Collaboration INRAE/LABÉO – Thèse de Léna Keij)
-Séquençage complet du virus de la grippe équine
– Surveillance des souches de grippe équine circulant en France pour l’OMSA (Organisme mondiale de la santé animale)
Projet VACADEq – Thèse de Flora Carnet
– Etude de l’effet du parapoxvirus ovis sur la réponse immunitaire humorale après vaccination par
Un vaccin contre la grippe équine
Un vaccin contre la rhinopneumonie équine
– Nouvelle approche de la mesure des anticorps anti-EIV par impédancemétie
Projet OVERLORD : Thèse et Post-doctorat de Stéphanie Fougerolle
-Etude de l’évolution des souches du virus influenza en France – recherche de marqueurs de pathogénicité
– Etude de différents facteurs influençant la réponse humorale suite à la vaccination contre la grippe équine
Virus émergents
Projet Tétrade hépatique
-Outils de surveillance et de caractérisation moléculaire des hépacivirus, parvovirus, pégivirus équins et du TDAV
-Suivi épidémiologique des virus hépatiques
-Etude des modes de transmission
